眼科是扬州东方医院的特色重点专科，不仅从德国、美国、日本、英国等国家引进了国际先进的各种眼科诊疗仪器设备，而且拥有一支德技双馨，由张雷、石凡军、樊小娟等领衔的精干强悍的专家团队，拥有眼科主任医师、副主任医师3人，眼科学博士、硕士各一名。
特聘国内眼科界著名领军人物周行涛（复旦大学附属眼耳鼻喉科医院院长）、刘庆淮（江苏省人民医院眼科主任）、郑历（浙江省杭州明视康眼科医院院长）、周激波（上海交通大学医学院附属第九医院眼科视光中心主任）、李健民（原兰州军区总医院眼科主任）、史煜（南京鼓楼医院眼科博士后）、丁月琴（复旦大学附属眼耳鼻喉科医院知名视光与斜弱视学科专家）等，担任眼科特聘专家，定期前来指导、交流、会诊。
我院眼科在飞秒激光和晶体植入矫正近视等各种屈光不正、疑难眼底病诊治、白内障防治、糖尿病性视网膜病变防治、各种复杂青光眼诊治、青少年近视防控、儿童斜弱视诊治、鼻腔内窥镜辅助下的泪道疾病诊治、医学验光配镜等领域居先进水平。
我院眼科专家不仅应邀在国内外眼科学术会议上交流，在国际顶级专业学术期刊上发表论文，还成功承办了多场眼科学术会议，受到省内外同行的好评。
东方医院神经外科成立于2005年9月，长期秉持“一流技术、一流服务”的宗旨，组建高水平神经外科团队。我科现有专科医生9人，其中主任医师1人，副主任医师2人、主治医师2人，住院医师2人，助理医师2人。医疗由两名三甲医院神经外科骨干医生领衔。建科17余年来始终锚定“双一流”宗旨服务患者，逐步建立起规范、优质、亲和的科室形象，获得社会的广泛好评。
科室拥有神经重症监护病床8张，专科病床40张。专科手术室为百级层流手术间，配备德国Lycra手术显微镜、美国Medtronic手术动力系统、美国Mayfield多功能手术头架、德国Snake显微手术器械等设备；神经重症病房拥有多台德国Drager呼吸机、美国Codman颅内压监护仪、床旁脑电监护仪、高清纤维支气管镜、德国Braun床旁血滤、美国Radiometer血气分析仪等设备。
我科有能力开展的技术项目涵盖二级医院业务项目和部分三级医院业务项目，其中重型颅脑损伤和复杂多发伤的多学科救治、颅脑和椎管内肿瘤微创手术治疗、脑血管畸形及高血压脑出血的微创手术治疗、脑积水分流手术、颅骨成形手术、慢性硬膜下血肿针刺引流等技术项目均取得优良治疗效果，积累了丰富临床经验。